Хороший вопрос -.

Они точно могут обмениваться данными и работать одновременно.

Насчет конвертации - нет , нельзя конвертировать, S3 совсем другая система.

В начале предполагалась возможность исполнять проекты Silver в S3, но потом от этой идеи отказались, так как для S3 разработали абсолютно новый Softlogic с нуля, тогда как в Silver в качестве Softlogic использовался ISAGraf.